穿透式測量，能夠查驗全部穿透層物料水分的平均值，計算的是物料表面和內部的水分之和，查驗作用更具代表性。上面一個微波能量發射探頭，穿透物料后，上面有個吸收探頭，吸收微波丟掉后的能量。

依據能量的丟掉量來計算水分的百分比含量。微波原理水分儀對物料的顏色修正不靈敏，對物料的配方的修正不靈敏，當物料的表里水分不平均時，以及當物料的顆粒較大的狀態下，建議最好選用微波原理的，因為微波是穿透式測量，查驗作用非常好。但微波不能查驗很冷酷的物料，也不能查驗很厚的物料。

比方管道里面的物料很稀少，皮帶上面的物料很冷酷，微波原理的就會有影響，不適宜查驗。相同的道理，假如物料格外厚的話，微波的能量也穿透不了，也不適宜。

微波原理的不能查驗結晶水。可是如紅外不能查驗的很多物料，微波的則能夠查驗，比方查驗煤，微波的很適宜。并且電廠用的煤種是修正的，常常換的，紅外原理的則不適宜，微波的適宜。

鋼廠的燒結料假如配方是肯定的，建議用紅外，可是配方常常變的狀態下，建議用微波，微波的不靈敏。